造血干細胞移植工作始于二十世紀70年代，是國內最早開展自體造血干細胞移植的單位之一。當年侯虞華教授、張伯龍教授先后自英國學習歸來，將該技術開始應用于血液腫瘤的臨床治療。90年代起，在沈悌教授、武永吉教授的領導下，移植數量及病種開始逐年上升，目前已發展成擁有6張百級層流病房，6張過渡病房、1個造血干細胞實驗室的現代化造血干細胞移植中心。
目前我中心可以完成自體、親緣異體、HLA不全相合、無關等不同供者移植，可以完成外周血、骨髓等多種來源干細胞移植，也可以開展標準和降低強度的不同預處理方式移植。移植方式主要依病種、病人狀況、供者來源等進行選擇。其中自體移植治療自身免疫病、POEMS綜合征的診治水平基本接近世界先進水平，針對PNH、淋巴瘤、骨髓瘤、淀粉樣變性等疾病的移植規模和經驗也達到國內先進水平。我中心是中華骨髓庫認證通過的移植醫院和干細胞采集醫院，可以為患者爭取到更多的異體移植機會。
本中心依托協和醫院強大的臨床綜合診治實力，通過與免疫科、呼吸科、婦產科、放療科、輸血科、檢驗科、ICU等兄弟科室的合作，不僅有利于積極拓展移植適應癥，而且充分保證了圍移植期各種合并癥和并發癥的正確診斷和治療。現代移植技術的發展進入全新的時代，成功植入干細胞已經不是主要的困難，各種新技術新方法產生的免疫紊亂會導致一系列并發癥，正確處理這些移植相關并發癥的重要性，甚至超過了移植本身。因此，在北京協和醫院這樣一所國內權威的疑難重癥診療中心，患者將獲得全方位的診斷和治療的便利。
本中心有合理的人才梯隊，主要從事移植的人員包括周道斌教授、段明輝副教授、張薇副教授等，以及專業的移植護理隊伍。

本中心接受治療的主要疾病包括：
? 急性白血病和骨髓增生異常綜合癥：主要實施異基因造血干細胞移植，根據病人和供者條件，可采用清髓或非清髓移植。
? 淋巴瘤和多發性骨髓瘤：首選自體造血干細胞移植，部分病人可行異基因造血干細胞移植。
? POEMS綜合征和系統性淀粉樣變性：主要采用自體造血干細胞移植，目前居國內領先。
? PNH（陣發性睡眠性血紅蛋白尿）：主要行異基因造血干細胞移植。
? 骨髓增殖性疾病：目前開始探索的疾病。
? 自身免疫性疾病：和我院風濕免疫科合作，行自體外周血造血干細胞移植，達到國際先進水平。